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关于肽

 

肽库的应用


肽库是一种研究蛋白质结构和功能的新方法,它包含了许多由一系列氨基酸组成的肽,成为药物设计、蛋白质间相互作用、生物化学及药物应用等方面一种强有力的工具,同时在药物筛选、确定靶位、抗原表位制图、研制疫苗等方面也有着广泛的应用。肽库的其它应用如下:

· 受体配体的筛选

· 药物肽的发现

· 蛋白质间相互作用

· 蛋白质组功能

· 肽核酸

· 酶底物或肽酶抑制剂的筛选

· 抗原结合位置或抗原表位制图

· T细胞表位的发现

· 抗体在抗原(蛋白质)上结合位置

· 抗体与相关蛋白质的交叉反应

· 短肽抗原的鉴定


肽库的规格


本公司提供肽库的纯度范围(脱盐、>70% >80% >90%>95%)。根据客户需求,我们提供从最小量到毫克级质量的肽 ,修饰或标记肽(如生物素、荧光标记等)。我们对肽库里的每条肽都进行严格的质量控制,从而避免交叉污染,且每条肽都附有可靠的RP-HPLC MSCOA 分析资料。对于脱盐的肽,我们只提供质谱报告。肽库中的肽一般含有5~15个氨基酸(重叠1~5个氨基酸)。


肽库的类型


根据其应用,肽库一般分为:


A. 重叠肽库

重叠肽库可以用于抗原表位制图。根据全蛋白的长度、实验目的和所需费用,来确定肽的长度(5-15个氨基酸)和偏移数或重叠氨基酸的数目(2-5个氨基酸)。一般来讲,肽长度越短,得到多抗原表位数的机会越小;重叠度越高(偏移数小),得到多抗原表位数的机会越大。


例如:  (肽长度为10个氨基酸,偏移数为 3个氨基酸)

       DSTRKLMNRT QSEDKLPSRG QHTRSDKENN PSSTRGHLED (30 aa protein)

       DSTRKLMNRT                                Peptide #1

           RKLMNRTQSE                           Peptide #2

                  MNRTQSEDKL                   Peptide #3

                       TQSEDKLPSR              Peptide #4

一共有11条肽。


B. 丙氨酸筛选肽库

例如:   (肽长度为10个氨基酸)

       DSTRKLMNRT                      Peptide #1

       ASTRKLMNRT                      Peptide #2

       DATRKLMNRT                      Peptide #3

       DSARKLMNRT                      Peptide #4

       DSTAKLMNRT                      Peptide #5

       DSTRALMNRT                      Peptide #6

       DSTRKAMNRT                      Peptide #7

       DSTRKLANRT                       Peptide #8

       DSTRKLMART                      Peptide #9

       DSTRKLMNAT                      Peptide #10

       DSTRKLMNRA                      Peptide #11


C. 短肽库

短肽库用来识别有特定功能或活性的最短氨基酸序列。  

例如:  (肽长度为10个氨基酸)从N端切断

       DSTRKLMNRT               Peptide #1 (control peptide with full function)

        STRKLMNRT                Peptide #2

         TRKLMNRT                 Peptide #3

           RKLMNRT                 Peptide #4

              KLMNRT                 Peptide #5

               LMNRT                  Peptide #6

                  MNRT                 Peptide #7

短肽库也可以从C端切断。


D. 随机/杂乱肽库

杂乱肽库是由变换原始肽的序列建立起来的。肽中每个氨基酸的数目(如2个精氨酸)是相同的,只是它和其余氨基酸的位置是随机的。其目的就是在一组有活性的序列中初步鉴别可能拥有特定功能或活性的肽。

       DSTRKLMNRT              Peptide #1 (control peptide with full function)

       TRLKSTNRMD              peptide # 2

       RSTRLDMNKD             peptide # 3

等等……


E. 位筛选肽库

在一条肽的序列中,一个或几个氨基酸位置分别被天然氨基酸(20个)或其它的氨基酸有系统的替换,用来确定在特定的位置哪种氨基酸能使肽有最大活性。

例如:  (肽长度为10个氨基酸,替换第5个氨基酸-赖氨酸)

       DSTRKLMNRT                       Peptide #1 (control peptide)

       DSTRALMNRT                       Peptide #2

       DSTRCLMNRT                       Peptide #3

       DSTRDLMNRT                       Peptide #4

       DSTRELMNRT                       Peptide #5

       DSTRFLMNRT                       Peptide #6

       DSTRGLMNRT                      Peptide #7

也可以替换第8个氨基酸(天冬酰胺)进行实验。