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Lexogen公司Spike-in RNA Variants (SIRVs)

——专为验证RNA测序效果而设计



 作为强有力的转录组分析工具,RNA测序已经被应用到众多研究项目中,并且很有希望将其应用范围进一步扩展到诊断与治疗领域中。为保证分析的有效性,实验室测试必须提供可重复性和稳定性俱佳的精准信息。分子量标准和对照是唯一可以准确无误的判定实验可靠性的方式。Lexogen公司研发的SIRVs可以评估转录组测序实验的质量,分为Set 1Set 2Set 3三类。


SIRV-Set 1 (Iso Mix E0, E1, E2)

Cat No. 025.03   15,360


产品介绍

Spike-In RNA VariantsSIRVs)是为验证RNA测序效果而设计的一系列转录物,特别是可以验证生物信息学算法如何纠正文库制备和测序过程中引入的偏差。SIRV-Set 1包括3isoform混合物,E0E1E2,它们包含同样的合成转录物,但浓度不同。它可以与不同的RNA样品一起使用(总RNApoly(A)筛选RNA,或去除rRNARNA),也可以兼容不同的文库制备方法以及测序平台。


特点与应用

l 全面反映可变剪接,可变转录起始、终止位点,重叠基因以及反义转录的差异

l 深入验证isoform检测以及量化的实验效果

l 验证mRNA量化流程的效果

l isoform水平上评估基因的差异性表达


试剂盒内容

l 该试剂盒包括SIRV混合物E0E1E2各一支,即3管分别含有3种不同浓度的69SIRV isoform转录物。

l 每支混合液的4ul溶液足以使用3次、每次1ul的上百个100ngRNA-Seq样品(或上百万个单细胞RNA-Seq样品)

l 分子生物级别水,用以稀释RNA


系统兼容性

与几乎所有的RNA测序方法兼容,包括poly(A)筛选方法(仅不兼容特定Cap制备方法)


SIRV-Set 2 (Iso Mix E0)

Cat No. 050.01    4,455元    

Cat No. 050.03    8,895


产品介绍

Spike-In RNA VariantsSIRVs)是为验证RNA测序效果而设计的一系列转录物,特别是可以验证生物信息学算法如何纠正文库制备和测序过程中引入的偏差。SIRV-Set 2只包括1isoform混合物E0,其包含69种等摩尔浓度的isoform。它可以与不同的RNA样品一起使用(总RNApoly(A)筛选RNA,或去除rRNARNA),也可以兼容不同的文库制备方法以及测序平台。


特点与应用

l 全面反映可变剪接,可变转录起始、终止位点,重叠基因以及反义转录的差异

l 有效评估不同isoform的工作效果

l 可调节感兴趣的浓度窗口,适用于低读取的实验要求

l 验证并控制mRNA量化流程

l 评估实验的一致性,来分析数据的可对比性


试剂盒内容

l 该试剂盒包括1管或3SIRV混合物E0,每管内包括等摩尔浓度的69isoform转录物。每管内的干物质需要重新溶于水,可以用于至少9倍于数十上百的RNA-Seq样品(或上百万个单细胞RNA-Seq样品)。

l 分子生物学级别水,用于重溶以及稀释RNA样品


系统兼容性

与几乎所有的RNA测序方法兼容,包括poly(A)筛选方法(仅不兼容特定Cap制备方法)


SIRV-Set 3 (Iso Mix E0 / ERCC)

Cat No.  051.01   6,675元    

Cat No. 051.03   13,350



产品介绍

Spike-In RNA VariantsSIRVs)是为验证RNA测序效果而设计的一系列转录物,特别是可以验证生物信息学算法如何纠正文库制备和测序过程中引入的偏差。SIRV-Set 3包括isoform混合物E0,和一支ERCC混合物。E0混合物包括69种等摩尔浓度的SIRV isoform,用以达到isoform复杂度的要求;另外,在6个数量级的浓度范围内的、由92种独特序列非isoform组成的ERCC转录物作为补充。它可以与不同的RNA样品一起使用(总RNApoly(A)筛选RNA,或去除rRNARNA),也可以兼容不同的文库制备方法以及测序平台。


特点与应用

l 全面反映可变剪接,可变转录起始、终止位点,重叠基因,反义转录,以及不同浓度带来的差异

l 有效评估不同isoform的工作效果

l 覆盖了整个内源性RNA的动态范围

l 适用于低读取的流程要求

l 验证并控制mRNA量化流程,isoform检测及浓度测量

l 评估实验的一致性,来分析数据的可对比性


试剂盒内容

l 该试剂盒包括1管或3SIRV isoform混合物E0,以及1ERCC混合物。

l 每管内的干物质需要重新溶于水,可以用于至少9倍于数十上百RNA-Seq样品(或上百万个单细胞RNA-Seq样品)。

l 分子生物学级别水,用于重溶以及稀释RNA样品


系统兼容性

与几乎所有的RNA测序方法兼容,包括poly(A)筛选方法(仅不兼容特定Cap制备方法)




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