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Library Prep Kits for Gene Expression Analysis of Blood

   我们为QuantSeq试剂盒研发出了新的球蛋白封阻模块(Globin Block Module),这些模块扩展了QuantSeq 3’ mRNA-Seq Library Prep试剂盒的功能范围,使其能够被用于全血样品的基因表达谱分析,而这是转录组研究中最具挑战性的样品种类之一。

血液是一种高信息量、低成本的、微创性的样品类型,广泛用于临床研究。此外,对血液样品进行RNA测序,是一种有利于发现生物标志物及研究生理和病理生理过程的基因表达的方法。然而,全血液中大量的球蛋白,消耗了大约50-80%的测序读取量,这对低浓度的转录本的分析是一个巨大的挑战。

   Lexogen公司全新推出的球蛋白封阻模块:Globin Block Modules for QuantSeq 可以高效低成本地让球蛋白读取率降低高达91%。使用这些模块以后,可以检测和量化成千上万更多的基因。与目前所用的通过在文库制备之前,将球蛋白mRNA从全血RNA中去除的方法不同,我们新推出的模块可以直接在文库制备过程中减少球蛋白的干扰。

   新模块的设计方式为,在不增加任何额外步骤到QuantSeq试剂盒原有实验步骤的情况下,直接阻止球蛋白mRNA生成cDNA文库片段。这些模块由单一的球蛋白封阻剂组成,只需简单地将QuantSeq试剂盒中的标准RNA移除剂(RNA Removal Solution)替换成该模块即可(图1)。

   图1. 使用球蛋白封阻模块来去除球蛋白干扰的QuantSeq流程示意图。全血样品的总RNA中包括球蛋白mRNA和非球蛋白mRNA的混合物,在第一链合成的过程中都会被oligo(dT)引物识别并逆转录。RS-Globin Block(RS-GB)模块添入到QuantSeq试剂盒中,替换掉原本的标准RNA移除剂(RS)。在去除RNA后,球蛋白封阻引物会特异性结合到球蛋白cDNA第一链上,结合点在随机引物下游,封阻球蛋白cDNA第二链的合成。在第二链合成后,样品内将包含未扩增的球蛋白cDNA片段和带标记的、由非球蛋白mRNA合成的双链cDNA文库片段。在PCR过程中,只有非球蛋白文库片段能够被扩增并加入Illumina测序所需的全长接头序列(adaptor)和索引序列(index)。

   球蛋白封阻模块现有分别适用于人类样品(RS-Globin Block, Homo sapiens, 目录号:070.96)和猪样品(RS-Globin Block, Sus scrofa, 目录号:071.96),并包含足够96次反应的量。同时使用球蛋白封阻模块和QuantSeq试剂盒时,最小样品投入量低至50ng的全血总RNA,比市场上其它方法所需的量要低20倍。

   QuantSeq 3’ mRNA-Seq Library Prep技术已经广泛应用于各种样品类型的基因表达分析,如组织、细胞以及石蜡包埋样品。由于其较短的工作流程,低廉的成本,高灵敏度以及可重复性,它已经成为高通量与小型研究项目均可采用的首选方法。

在使用QuantSeq时添加球蛋白封阻模块,每个样品只需要增加很少的成本,这使得QuantSeq成为市场上能应用于广泛样品类型的、最具成本效益的基因表达分析方法。

了解更多:

访问球蛋白封阻模块的网页

查看球蛋白封阻模块的指导手册

访问QuantSeq 3’ mRNA-Seq Library Prep的网页

订购信息:

产品名称

规格

货号

价格(元)

RS-Globin Block人类(Homo sapiens)模块,RS-GBHs

96

070.96

6525

RS-Globin Block猪(Sus scrofa)模块,RS-GBHs

96

071.96

5670