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锁核酸(LNA)Oligo合成

 

产量

单价(元/base

出货时间

2 OD

300/base

3-4工作日交货

5 OD

350/base

10 OD

500/base


 

性能

 

       当与互补的DNA或者RNA链杂交时,LNA寡核苷酸表现出前所未有的热稳定性。对于每一个嵌入的LNA单体,其双链的Tm值增加2-8°C。此外,LNA寡核苷酸可比传统的DNA或者RNA寡核苷酸合成的更短,但是它还能保持高的Tm, 当它用于检测小的靶序列或者很相似的靶序列的时候,这一点尤为重要。

       由于LNA寡核苷酸通常是由LNADNA或者RNA的混合物组成,这样可以通过改变寡核苷酸中LNA含量来优化其敏感度与特异性。将LNA嵌入到寡核苷酸已被证明可以改善许多基于杂交技术的灵敏度与特异性,包括PCR、微阵列与原位杂交(ISH)。

       无论GC含量多少,Tm标准化(Tm normalization)使自动化检测成为可能。寡核苷酸双链的Tm值可以通过改变LNA的含量得以控制,这种特性被用于规范GC含量可以改变的短序列群体的Tm值。对于具有低熔点的AT丰富的寡核苷酸,更多的LNA碱基嵌入到LNA寡核苷酸可提高其双链的Tm, 这使具有窄范围TmLNA寡核苷酸设计成为可能,这种设计在许多研究应用中是有益的,例如微阵列、PCR等。在这些应用中,与许多不同靶序列的敏感性与特异性结合,要同时在相同的条件下进行。通过比较DNALNA探针检测一定GC含量范围内的miRNA靶序列,证明了Tm标准化(Tm normalization)的效应。

     

设计原理

 

设计LNA Oligos请遵循以下原则:

· LNA会与其它LNA残基紧密结合,避免自身互补以及与其它含寡核苷酸的LNA交叉杂交。

· GC含量保持在30-60%

· 避免连续超过4LNA残基,除非设计的寡核苷酸只有9-10核苷酸。

· 避免3个或者3个以上连续G或者C

应用范围

 

LNA Oligos已成功的广泛应用于下列领域:

· miRNA研究

· RNA研究

· SNP基因分型

· mRNA反义寡核苷酸

· 等位基因特异性PCR

· RNAi

· DNAzymes

· 荧光偏振探针

· 分子信标

· 微阵列基因表达谱分析

· 基因修复与外显子跳跃

· 拼接变异检测

· 比较基因组杂交(CGH