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环状DNARNA寡核苷酸的合成


单链环状DNA或环状RNA寡核苷酸被设计为单链DNARNA目标分子形成的三级结构(triplex formation)。很多这样的环状寡核苷酸分子比其在线性结构下具有更强的亲和性、序列选择性以及对核酸酶的更强的抗性。赛百盛公司可以使用部分受保护的线性前体分子为原料,通过液相或固相合成等化学合成的方法,合成出这些环状DNA或者环状RNA寡核苷酸。去除线性DNA后,环状寡核苷酸通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)被进一步纯化,纯度可达95%以上。环状是由核酸外切酶剪切决定的。最后一步,我们应用一种独立的QC过程来保证每个环状寡核苷酸达到最高品质。

 

规格


o 长度:35 - 200个核苷酸

o 产量:100, 200, 500皮摩尔

o 纯化:HPLC或者PAGE

o 检验:质谱和PAGE分析,以及附加的QC流程


环状寡核苷酸——分子诊断新概念


环状寡核苷酸可以作为一种有效的DNARNA模板,可以在滚环扩增PCR(rolling circle PCR)应用中,生成环状序列的长且重复的拷贝。在其它应用环状寡核苷酸于诊断和治疗的策略中,也表现出了有趣的特性。

o 环状寡核苷酸的反义应用

o 双链DNA的结合

o miRNA的传递载体

o 诊断学

o 用缺口酶系统装配DNA片段

o DNA聚合酶抑制

o DNA的结构研究

o 高效的DNARNA聚合酶模板

o 发夹结构的单元设计

o 发夹结构的研究

o 不需连接的克隆方式(LIC

o 用环状寡核苷酸操控基因表达

o 突变检测

o 锁式(padlock)探针

o 探测DNA-蛋白质的相互作用

o 对序列相关的DNA弯曲(bending)和弹性(flexibility)的定量分析

o RNA聚合酶抑制

o 滚环扩增(RCA

o 单分子计数

o 特定基因的表达

o 非典型(noncanonical )DNA结构单元的研究

o 多联体(concatemeric)多肽的合成

o 拓扑修饰

o 三螺旋的形成

o 独特的DNA识别属性

 

环状DNA和环状RNA的定制化合成


赛百盛公司的定制DNA或定制RNA合成服务可以为客户提供大量选择,以满足多种多样的科研需求。我们为ISO质量管理体系认证企业,确保客户能够对我们的产品和服务达到高满意度。

 

案例分析:


序列:91 basesDNA合成

TTC ACA GAG GAA GGG CCA GTA TCC TGT CCA AAC TTG ATG CTC CGG T CGT TTA GCA TAC TAA TCT GAG AGT CCG ACG GTC GTC AGT CAG TCA

 

变性凝胶电泳结果:



 

ESI 质谱检测结果:


91 bases的线性单链DNA,目标分子量:28128.1, 实测分子量: 28126.9


91 bases的环状单链DNA,目标分子量: 28110.1, 实测分子量: 28111.1