21世纪初期,二代测序(NGS)成为应用日益广泛的商业化技术。在十几年的时间里,数据的大量生成为分子生物学领域带来了巨大的进步。从1964年首个被测序的tRNA分子到如今人类基因组测序的实现,科技以极快的速度在发展。与此同时,引发了对高纯度、高质量的相关产品的需求,如寡核苷酸(oligonucleotides)的合成。
在文库构建过程中由于DNA接头(barcodes)的使用而造就的二代测序的多重分析能力(multiplexing ability)为研究者们提供了在一次运行中进行多个样本测序的高价值工具。每个样本都通过连接反应或PCR反应与独特的寡核苷酸接头连接,而后汇集在一起,在一次NGS上机中完成测序。此后研究者们可以通过鉴别接头的不同而区分不同的片段。然而,寡核苷酸接头间的交叉污染而导致的待测片段的误读,很可能使得这一高价值、高效率的工作流程被玷污或贬值。
寡核苷酸的合成与纯化过程对于降低NGS处理偏差或降低由于接头交叉污染而造成的结果贬值具有至关重要的意义。生产实验室应该确保没有空气污染,并且要彻底清洁。由于寡核苷酸的生产通常是批量化的,每批含96到384个寡核苷酸,因此用于寡核苷酸生产与纯化的硬件必须确保良好维护且无寡核苷酸污染。另外,纯化介质(例如,HPLC纯化柱和RP-cartidges样品处理柱)在多批次寡核苷酸生产中的反复使用也是造成接头交叉污染的一个主要风险源。即便对这些媒介进行严格的清洗与再生(regeneration),也不足以控制交叉污染的发生。
高纯度、高质量
赛百盛公司NGS Oligos的生产采用专用流程。
NGS Oligos是由专门的设备、硬件与技术人员来完成。
每条寡核苷酸的纯化介质仅限使用一次,排除交叉污染的可能。
每条NGS Oligos都要进行PAGE检测和质谱分析,确保其达到了正确的纯度与质量。
随着测序平台通量的提升,降低测序费用的普遍方式在于多重样本处理的应用。然而,即便是极微量的接头交叉污染都有可能使测序实验损失惨重,浪费金钱与工时。在测序应用涉及的众多分子生物学技术中,寡核苷酸处于关键地位。因此选择合适的寡核苷酸供应商会对您的实验结果的质量产生巨大的影响。赛百盛公司提供的NGS Oligos可以与Illumina,Ion Torrent™或 Pacbio平台兼容。
赛百盛公司 NGS Oligos
产量 |
单价(元/base) |
出货时间 |
备注 |
2 OD |
2.60 |
5-6个工作日 |
每条oligo都提供质谱分析图 |
5 OD |
3.80 |
10 OD |
5.80 |
30 OD |
16.00 |
6-7个工作日 |
50 OD |
22.00 |
100 OD |
38.00 |
注:在以上报价的基础上每条NGS Oligo再加收100元。 |