RiboCop rRNA Depletion Kit (人类/大鼠/小鼠)
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总RNA中包含大量核糖体RNA(rRNA)，通常人们对这些rRNA没有研究兴趣。Lexogen公司的RiboCop rRNA Depletion试剂盒可以高效的从完整的或降解的大鼠、小鼠和人类总RNA样本中清除rRNA。这些清除了rRNA的RNA样本可以用于二代测序（NGS），或其它高要求的RNA分析应用。 |
| 优势： |
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高度特异性地清除(高达99.8 %)人类、小鼠、大鼠RNA样本中的细胞质rRNA (28S, 18S, 5.8S, 5S, 45S)和线粒体 (mt16S, mt12S) rRNA。 |
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适用于完整的或降解的RNA (比如 , FFPE样本) |
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灵活的RNA投入量 (1 ng - 1 μg的总RNA投入量) |
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自动化友好的操作流程 — 磁珠纯化 |
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简单稳定的工作流程 — 无酶促反应和机械剪切步骤 |
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可以与任何RNA测序的建库试剂盒无缝对接 (包括Lexogen公司的SENSE Total RNA-Seq) |
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工作流程：
亲和探针和总RNA (1 ng – 1 μg)混合在一起并使之变性，可以促进探针接近靶标序列。而后，RNA和探针的杂交在高温下完成。同时，清除磁珠(depletion bead)按要求处理，用于从溶液中清除探针以及杂交后的核糖体RNA。最终的纯化步骤是通过磁珠清除残余的RNA来完成。整个流程通过使用磁珠达到rRNA的清除和纯化的目的，便于实现自动化操作，并在2小时内便捷、快速的清除rRNA。
图 1 | RiboCop试剂盒工作流程原理概述 |
性能：
RiboCop试剂盒为人类、大鼠和小鼠的总RNA样本提供了高达99.8 %的rRNA清除效率(表 1)。即使是高度降解的样本如FFPE，同样可以用于RiboCop rRNA depletion kit。标准回收率在RNA投入量的1-3%范围内变动，且对投入材料存在高度依赖性。此外，RiboCop的重复性极好。对于投入量为100ng的人类RNA样本，重复试验R2>0.99 (参见SENSE, 图2)。
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表 1 | Lexogen公司的RiboCop rRNA Depeletion Kit使得清除效率高达99.8%。经RiboCop试剂盒处理后的材料，并使用Lexogen公司的SENSE Total RNA-Seq Library Prep Kit构建适用于Illumina平台的文库，在HiSeq设备上完成测序。读数结果与rRNA参考序列比对，并以对应的未清除rRNA的文库为参考实现定量化。表格中列出的数值是每个反应投入100ng总RNA。UHRR — 通用的人类参考RNA；HBRR — 人类大脑参考RNA；mt rRNA — 线粒体rRNA。 |
订购信息：
产品名称 |
规格 |
货号 |
价格（元） |
RiboCop rRNA Depletion Kit |
24 preps |
037.24 |
13,970 |
RiboCop rRNA Depletion Kit |
96 preps |
037.96 |
39,530 |
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